Neben seiner beeindruckenden Dauerausstellung bietet das Akropolismuseum noch mehr zu entdecken. Unter dem Hauptgebäude zeigt das Ausgrabungsmuseum ein antikes Athener Viertel mit gut erhaltenen Häusern, Werkstätten und Straßen, die sich von der klassischen bis zur byzantinischen Zeit erstrecken. Die Besucher können auf Glasböden gehen, um das Gelände von oben zu betrachten. Der kürzlich eingeweihte Ausstellungsflügel des Museums erweitert das Erlebnis mit neuen Sammlungen und interaktiven Displays, die tiefere Einblicke in die Geschichte der Akropolis bieten. Der Eintritt in das Ausgrabungsmuseum ist in der allgemeinen Eintrittskarte für das Akropolismuseum enthalten.